20年前（1989年）、アメリカの砂漠地帯に謎の発光体が墜落。米軍は数体の不定形生命体を捕獲した。その生命体が来訪者であり、彼らは超新星爆発によって故郷を追われ、光量子情報体となって地球に飛来したのだった。
来訪者はオーバーテクノロジーをもたらしたが、その技術はスペースビーストによる「終焉 = 地球の滅亡」を防ぐためにのみ使うことを許された。
5年前（2004年）、新宿で起こったウルトラマン（ファースト・デュナミスト：真木舜一）とビースト（ザ・ワン：有働貴文）の戦いを知る世界中の人々の記憶は、「ビーストの記憶がさらなるビーストの災厄をもたらす」という危険性から、来訪者によって忘却の海「レーテ」に封印された。
レーテはウルトラマンと同様のエナジーコアを備えた物体で、その中に恐怖や憎しみを封印しており、凪が憎しみに囚われたままエボルトラスターを引き抜いたことでその内部の闇とシンクロした。
解き放たれた闇は光の力を吸収し、石堀はついにダークザギ完全復活の目的を達成したのだ。